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教程(十一)GaussView使用技巧-高亮原子的妙用

关键词:GaussView 高亮原子    发布时间:2019-07-07 11:51:12    点击数:168

(一)引言:

➢ GaussView中有很多功能,但我们平时在使用时用到的功能较少。本系列将结合笔者多年的使用经验,介绍GaussView的使用技巧。
➢ 在使用GaussView建模时,当要构建两个分子反应(A+B→AB)的产物结构时,通常会考察不同反应位点的情况,此时可以通过高亮原子功能得到不同的产物结构。本文将以叔丁烷的伯碳、叔碳自由基与苯酚反应介绍如何使用高亮原子达到快速、精准建模。


苯酚与叔丁烷反应结构图


(二)建模过程:

1. 叔丁基与苯酚的构建
█ 软件版本GaussView 6
█ 首先画出两个反应物,是比较简单的一步,所以不再赘述。结构如下:
█ 本例中可以使用分子组窗口模式(Molecule Group),图标为 ,然后将需要构建的分子放在一个页面。


苯酚及叔丁烷分子结构


2. 构建不同产物
█ 通过观察产物结构,本反应产物主要是伯碳、叔碳自由基与O原子形成不同醚类产物的过程。因此先选中2号窗口,然后点击复制分子结构,图标为


复制的叔丁烷结构


█ 从上图可以看出复制的叔丁烷结构中的高亮原子为伯碳,然后可以通过鼠标左键点击不同位置的碳原子,调整高亮原子位置,如下图:


伯碳和叔碳位置的预览窗口


█ 然后分别将选定的结构在1号窗口,用鼠标左键点击-OH键上的H原子,两个不同的产物结构就画好了,如下图:


伯碳和叔碳结构得到的不同醚类产物


█ 上述方法在构建不同反应位点的产物时具有快速、精准的特点,希望读者能够在实际研究中灵活运用。

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