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Gaussian软件在药学领域的应用

关键词:    发布时间:2014-03-07 17:23:01    点击数:3295

应用范例一:

哌啶类化合物是应用广泛的天然产物及药物,如奎宁、吗啡及西力士等,因此对于此类药物的研究备受关注。本文报道了一种高取代及区域选择性合成哌啶衍生物的方法。

 

高斯软件的作用:

使用Gaussian软件辅助确定了目标产物的结构及分析了一系列化合物的热力学、动力学。

 

Proton Donor Acidity Controls Selectivity in Nonaromatic Nitrogen Heterocycle Synthesis

Simon Duttwyler et al. Science 339, 678 (2013)

 

应用范例二:

定量预测配体与大分子结合能对于计算药物化学来说是一项非常重要的工作,这对先导物优化及其它过程有着重要的指导作用。配体互变异构现象在药物化学中是常见的现象,然而经典分子力学很难描述此种情况。本文通过多种计算方法组合,得到了很好的结果。

 

高斯软件的作用:

使用Gaussian软件(ONIOM方法)优化了蛋白-配体的结构(不同互变异构体),并对体系做了能量计算,再与其它方法组合,得到了与实验log(1/C50) 吻合的结果。 

 

Binding Affinity Prediction for Ligands and Receptors Forming Tautomers and Ionization Species: 

Inhibition of Mitogen-Activated Protein Kinase-Activated Protein Kinase 2 (MK2)

Senthil Natesan et al. J. Med. Chem. 2012, 55, 2035 

 

 

 

 

 

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